Az Eurojust a nemzeti hatóságokkal együttműködve felveszi a harcot a határokon átnyúló legkülönbözőbb, két vagy több országot érintő súlyos és összetett bűnözéssel. Az Ügynökség irányítja az Európában növekvő veszélyekre adott igazságügyi válaszlépéseket, ezzel lehetővé téve, hogy a tagállamok egy lépéssel a bűnözők előtt járjanak, mindenekelőtt a bűnszervezetekre koncentrálva. Az Eurojust elé kerülő ügyek gyakran több mint egy bűncselekménytípust érintenek.

A prioritást képező bűncselekménytípusok közé tartoznak a következők:

• Terrorizmus
• Kiberbűnözés
• Emberkereskedelem
• Kábítószer-kereskedelem
• Az Unió pénzügyi érdekei elleni bűncselekmények (PIF-bűncselekmények)
• Migránsok csempészése
• Környezeti bűnözés
• Pénzmosás
• Csalás

Az Eurojust a határokon átnyúló nyomozati cselekmények különböző szakaszaiban testre szabott műveleti segítségnyújtással a következőket biztosítja:

• azonnal válaszlépések;
• a hét minden napján éjjel-nappal hívható koordinációs ügyeleti szolgálat;
• kapcsolattartás a legfontosabb partnerekkel; valamint
• az igazságügyi együttműködés iránti megkeresések előkészítésével kapcsolatos támogatás, ideértve a hivatalos fordításokat is.

Ezenkívül az Eurojust bonyolult segítségnyújtási formákhoz és koordinációs mechanizmusokhoz is tud alkalmazkodni, és ezeket nagyszabású műveletek támogatása érdekében szükség szerint össze is tudja vonni. Az Ügynökség biztosítani tudja például a következőket:

• párhuzamos nyomozások összehangolása;
• koordinációs értekezletek megszervezése az érintett igazságügyi hatóságok és bűnüldöző szervek részvételével;
• közös nyomozócsoportok felállítása és/vagy finanszírozása, ahol két vagy több ország hivatalos megállapodása alapján a nemzetközi nyomozati cselekményekben együttműködnek az igazságügyi hatóságok és a bűnüldöző szervek; valamint
• az Eurojust koordinációs központjaiból valós időben irányított közös akciónapok megtervezése, amelyek során a nemzeti hatóságok tetteseket tartóztathatnak le, bűnszervezeteket számolhatnak fel, illetve vagyontárgyakat foglalhatnak le.